هیات امنای شفا را گروهی از افراد فرهیخته، داوطلب، حرفه ای و معتقد به حذف فقر و نابرابری تشکیل میدهند. این هیات متشکل از 25 نفر اعضای حقیقی و حقوقی است. 15 نفر از هیات امنای شفا نماینده برخی شخصیت های حقوقی ذیربط می باشند. 10 نفر بقیه از هیات امنای شفا از بین افراد عالم و مطرح در حوزه فقرزدایی انتخاب میشوند.
در اولین دوره، هیات امنای شفا توسط هیات موسس انتخاب و فعال خواهد شد و در دوره های بعد بر اساس آیین نامه انتخابات که توسط سازمان شفا تهیه و به تصویب هیات امنا خواهد رسید ، اعضای هیات امنا تعیین خواهند گردید.
15 شخصیت حقوقی هیات امنا به شرح زیر پیشنهاد می گردد:
ده نفر شخصیت حقیقی هیات امنای شفا از بین افراد متخصص و مطرح و علاقمند به مقوله فقرزدایی و آشنا به نحوه شکل گیری انواع فقر و روشهای رفع فقر انتخاب می شوند.
مدت زمان دوره هر هیات امنا دو سال بوده و بعد از آن مطابق آیین نامه انتخابات افراد جدید انتخاب و جایگزین خواهند شد. انتخاب مجدد افراد در هیات امنا با توجه به ویژگی کار بلامانع است.
هر یک از اعضای هیات امنا مسئول شبکه تخصصی با فعالینی علاقمند از سراسر کشور(اندیشکده) خواهد بود. انتخاب اولین هیات امنای شفا به عهده هیات موسس شفا خواهد بود. ریاست هیات امنای شفا توسط هیات امنا انتخاب خواهد شد و دبیر هیات امنا (رییس سازمان شفا) متعاقبا توسط رییس هیات امنا انتخاب خواهد گردید.